Single-Cell RNA-sequencing Revolutionizes Our Understanding of Cancer Biology
Abstract
Cancer is a difficult to treat debilitating disease with a worldwide increasing trend. Tumor cells along with the cells in the tumor microenvironment contribute to cancer. Previously, cancer biology was studied at a tissue level which masked the tumor heterogeneity and interactions between different cell types in sustaining cancer. Single-cell RNA-sequencing is a recent revolutionary technique where mRNA can be measured in each individual cell in a tissue. Thus, every individual cell in a cancer tissue could now be transcriptionally profiled to study tumor complexity. Here, we discuss three recent examples where application of the single-cell technology has provided a wealth of knowledge of tumor heterogeneity, microenvironment diversity, how a change in microenvironment enables tumor growth, and how tumor-microenvironmental interactions sustain tumors. We also discuss the current challenges and future outlook.
Keywords
Full Text:
PDFReferences
Affo, S., A. Nair, F. Brundu, A. Ravichandra, S. Bhattacharjee, M. Matsuda, L. Chin, A. Filliol, W. Wen, X. Song, A. Decker, J. Worley, J. M. Caviglia, L. Yu, D. Yin, Y. Saito, T. Savage, R. G. Wells, M. Mack, L. Zender, N. Arpaia, H. E. Remotti, R. Rabadan, P. Sims, A. L. Leblond, A. Weber, M. O. Riener, B. R. Stockwell, J. Gaublomme, J. M. Llovet, R. Kalluri, G. K. Michalopoulos, E. Seki, D. Sia, X. Chen, A. Califano, and R. F. Schwabe. 2021. "Promotion of cholangiocarcinoma growth by diverse cancer-associated fibroblast subpopulations." Cancer Cell 39 (6): 866-882 e11. https://doi.org/10.1016/j.ccell.2021.03.012. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/33930309.
Ahmed, R., T. Zaman, F. Chowdhury, F. Mraiche, M. Tariq, I. S. Ahmad, and A. Hasan. 2022. "Single-Cell RNA Sequencing with Spatial Transcriptomics of Cancer Tissues." Int J Mol Sci 23 (6). https://doi.org/10.3390/ijms23063042. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/35328458.
Becht, E., L. McInnes, J. Healy, C. A. Dutertre, I. W. H. Kwok, L. G. Ng, F. Ginhoux, and E. W. Newell. 2018. "Dimensionality reduction for visualizing single-cell data using UMAP." Nat Biotechnol. https://doi.org/10.1038/nbt.4314. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/30531897.
Bischoff, P., A. Trinks, B. Obermayer, J. P. Pett, J. Wiederspahn, F. Uhlitz, X. Liang, A. Lehmann, P. Jurmeister, A. Elsner, T. Dziodzio, J. C. Ruckert, J. Neudecker, C. Falk, D. Beule, C. Sers, M. Morkel, D. Horst, N. Bluthgen, and F. Klauschen. 2021. "Single-cell RNA sequencing reveals distinct tumor microenvironmental patterns in lung adenocarcinoma." Oncogene 40 (50): 6748-6758. https://doi.org/10.1038/s41388-021-02054-3. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/34663877.
Cao, J., M. Spielmann, X. Qiu, X. Huang, D. M. Ibrahim, A. J. Hill, F. Zhang, S. Mundlos, L. Christiansen, F. J. Steemers, C. Trapnell, and J. Shendure. 2019. "The single-cell transcriptional landscape of mammalian organogenesis." Nature 566 (7745): 496-502. https://doi.org/10.1038/s41586-019-0969-x. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/30787437.
Cerami, E., J. Gao, U. Dogrusoz, B. E. Gross, S. O. Sumer, B. A. Aksoy, A. Jacobsen, C. J. Byrne, M. L. Heuer, E. Larsson, Y. Antipin, B. Reva, A. P. Goldberg, C. Sander, and N. Schultz. 2012. "The cBio cancer genomics portal: an open platform for exploring multidimensional cancer genomics data." Cancer Discov 2 (5): 401-4. https://doi.org/10.1158/2159-8290.CD-12-0095. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/22588877.
Chen, G., B. Ning, and T. Shi. 2019. "Single-Cell RNA-Seq Technologies and Related Computational Data Analysis." Front Genet 10: 317. https://doi.org/10.3389/fgene.2019.00317. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/31024627.
Cho, C. S., J. Xi, Y. Si, S. R. Park, J. E. Hsu, M. Kim, G. Jun, H. M. Kang, and J. H. Lee. 2021. "Microscopic examination of spatial transcriptome using Seq-Scope." Cell 184 (13): 3559-3572 e22. https://doi.org/10.1016/j.cell.2021.05.010. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/34115981.
Davis-Marcisak, E. F., A. Deshpande, G. L. Stein-O'Brien, W. J. Ho, D. Laheru, E. M. Jaffee, E. J. Fertig, and L. T. Kagohara. 2021. "From bench to bedside: Single-cell analysis for cancer immunotherapy." Cancer Cell 39 (8): 1062-1080. https://doi.org/10.1016/j.ccell.2021.07.004. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/34329587.
Efremova, M., M. Vento-Tormo, S. A. Teichmann, and R. Vento-Tormo. 2020. "CellPhoneDB: inferring cell-cell communication from combined expression of multi-subunit ligand-receptor complexes." Nat Protoc 15 (4): 1484-1506. https://doi.org/10.1038/s41596-020-0292-x. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/32103204.
Filliol, A., Y. Saito, A. Nair, D. H. Dapito, L. X. Yu, A. Ravichandra, S. Bhattacharjee, S. Affo, N. Fujiwara, H. Su, Q. Sun, T. M. Savage, J. R. Wilson-Kanamori, J. M. Caviglia, L. Chin, D. Chen, X. Wang, S. Caruso, J. K. Kang, A. D. Amin, S. Wallace, R. Dobie, D. Yin, O. M. Rodriguez-Fiallos, C. Yin, A. Mehal, B. Izar, R. A. Friedman, R. G. Wells, U. B. Pajvani, Y. Hoshida, H. E. Remotti, N. Arpaia, J. Zucman-Rossi, M. Karin, N. C. Henderson, I. Tabas, and R. F. Schwabe. 2022. "Opposing roles of hepatic stellate cell subpopulations in hepatocarcinogenesis." Nature 610 (7931): 356-365. https://doi.org/10.1038/s41586-022-05289-6. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/36198802.
Global Burden of Disease Cancer, Collaboration, J. M. Kocarnik, K. Compton, F. E. Dean, W. Fu, B. L. Gaw, J. D. Harvey, H. J. Henrikson, D. Lu, A. Pennini, R. Xu, E. Ababneh, M. Abbasi-Kangevari, H. Abbastabar, S. M. Abd-Elsalam, A. Abdoli, A. Abedi, H. Abidi, H. Abolhassani, I. A. Adedeji, Q. E. S. Adnani, S. M. Advani, M. S. Afzal, M. Aghaali, B. O. Ahinkorah, S. Ahmad, T. Ahmad, A. Ahmadi, S. Ahmadi, T. Ahmed Rashid, Y. Ahmed Salih, G. T. Akalu, A. Aklilu, T. Akram, C. J. Akunna, H. Al Hamad, F. Alahdab, Z. Al-Aly, S. Ali, Y. Alimohamadi, V. Alipour, S. M. Aljunid, M. Alkhayyat, A. Almasi-Hashiani, N. A. Almasri, S. A. A. Al-Maweri, S. Almustanyir, N. Alonso, N. Alvis-Guzman, H. Amu, E. W. Anbesu, R. Ancuceanu, F. Ansari, A. Ansari-Moghaddam, M. H. Antwi, D. Anvari, A. E. Anyasodor, M. Aqeel, J. Arabloo, M. Arab-Zozani, O. Aremu, H. Ariffin, T. Aripov, M. Arshad, A. Artaman, J. Arulappan, Z. Asemi, M. Asghari Jafarabadi, T. Ashraf, P. Atorkey, A. Aujayeb, M. Ausloos, A. F. Awedew, B. P. Ayala Quintanilla, T. Ayenew, M. A. Azab, S. Azadnajafabad, A. Azari Jafari, G. Azarian, A. Y. Azzam, A. D. Badiye, S. Bahadory, A. A. Baig, J. L. Baker, S. Balakrishnan, M. Banach, T. W. Barnighausen, F. Barone-Adesi, F. Barra, A. Barrow, M. Behzadifar, U. I. Belgaumi, W. M. M. Bezabhe, Y. M. Bezabih, D. S. Bhagat, A. S. Bhagavathula, N. Bhardwaj, P. Bhardwaj, S. Bhaskar, K. Bhattacharyya, V. S. Bhojaraja, S. Bibi, A. Bijani, A. Biondi, C. Bisignano, T. Bjorge, A. Bleyer, O. Blyuss, O. A. Bolarinwa, S. R. Bolla, D. Braithwaite, A. Brar, H. Brenner, M. T. Bustamante-Teixeira, N. S. Butt, Z. A. Butt, F. L. Caetano Dos Santos, Y. Cao, G. Carreras, F. Catala-Lopez, F. Cembranel, E. Cerin, A. Cernigliaro, R. C. Chakinala, S. K. Chattu, V. K. Chattu, P. Chaturvedi, O. Chimed-Ochir, D. Y. Cho, D. J. Christopher, D. T. Chu, M. T. Chung, J. Conde, S. Cortes, P. A. Cortesi, V. M. Costa, A. R. Cunha, O. Dadras, A. B. Dagnew, S. M. A. Dahlawi, X. Dai, L. Dandona, R. Dandona, A. M. Darwesh, J. das Neves, F. P. De la Hoz, A. B. Demis, E. Denova-Gutierrez, D. Dhamnetiya, M. L. Dhimal, M. Dhimal, M. Dianatinasab, D. Diaz, S. Djalalinia, H. P. Do, S. Doaei, F. Dorostkar, F. W. Dos Santos Figueiredo, T. R. Driscoll, H. Ebrahimi, S. Eftekharzadeh, M. El Tantawi, H. El-Abid, I. Elbarazi, H. R. Elhabashy, M. Elhadi, S. I. El-Jaafary, B. Eshrati, S. Eskandarieh, F. Esmaeilzadeh, A. Etemadi, S. Ezzikouri, M. Faisaluddin, E. J. A. Faraon, J. Fares, F. Farzadfar, A. H. Feroze, S. Ferrero, L. Ferro Desideri, I. Filip, F. Fischer, J. L. Fisher, M. Foroutan, T. Fukumoto, P. A. Gaal, M. M. Gad, M. A. Gadanya, S. Gallus, M. Gaspar Fonseca, A. Getachew Obsa, M. Ghafourifard, A. Ghashghaee, N. Ghith, M. Gholamalizadeh, S. A. Gilani, T. G. Ginindza, A. T. T. Gizaw, J. C. Glasbey, M. Golechha, P. Goleij, R. S. Gomez, S. V. Gopalani, G. Gorini, H. Goudarzi, G. Grosso, M. I. M. Gubari, M. R. Guerra, A. Guha, D. S. Gunasekera, B. Gupta, V. B. Gupta, V. K. Gupta, R. A. Gutierrez, N. Hafezi-Nejad, M. R. Haider, A. Haj-Mirzaian, R. Halwani, R. R. Hamadeh, S. Hameed, S. Hamidi, A. Hanif, S. Haque, N. I. Harlianto, J. M. Haro, A. I. Hasaballah, S. Hassanipour, R. J. Hay, S. I. Hay, K. Hayat, G. Heidari, M. Heidari, B. Y. Herrera-Serna, C. Herteliu, K. Hezam, R. Holla, M. M. Hossain, M. B. H. Hossain, M. S. Hosseini, M. Hosseini, M. Hosseinzadeh, M. Hostiuc, S. Hostiuc, M. Househ, M. Hsairi, J. Huang, F. N. Hugo, R. Hussain, N. R. Hussein, B. F. Hwang, I. Iavicoli, S. E. Ibitoye, F. Ida, K. S. Ikuta, O. S. Ilesanmi, I. M. Ilic, M. D. Ilic, L. M. Irham, J. Y. Islam, R. M. Islam, S. M. S. Islam, N. E. Ismail, G. Isola, M. Iwagami, L. Jacob, V. Jain, M. B. Jakovljevic, T. Javaheri, S. Jayaram, S. B. Jazayeri, R. P. Jha, J. B. Jonas, T. Joo, N. Joseph, F. Joukar, M. Jurisson, A. Kabir, D. Kahrizi, L. R. Kalankesh, R. Kalhor, F. Kaliyadan, Y. Kalkonde, A. Kamath, N. Kameran Al-Salihi, H. Kandel, N. Kapoor, A. Karch, A. S. Kasa, S. V. Katikireddi, J. H. Kauppila, T. Kavetskyy, S. A. Kebede, P. Keshavarz, M. Keykhaei, Y. S. Khader, R. Khalilov, G. Khan, M. Khan, M. N. Khan, M. A. B. Khan, Y. H. Khang, A. M. Khater, M. Khayamzadeh, G. R. Kim, Y. J. Kim, A. Kisa, S. Kisa, K. Kissimova-Skarbek, J. A. Kopec, R. Koteeswaran, P. A. Koul, S. L. Koulmane Laxminarayana, A. Koyanagi, B. Kucuk Bicer, N. Kugbey, G. A. Kumar, N. Kumar, N. Kumar, O. P. Kurmi, T. Kutluk, C. La Vecchia, F. H. Lami, I. Landires, P. Lauriola, S. W. Lee, S. W. H. Lee, W. C. Lee, Y. H. Lee, J. Leigh, E. Leong, J. Li, M. C. Li, X. Liu, J. A. Loureiro, R. Lunevicius, M. Magdy Abd El Razek, A. Majeed, A. Makki, S. Male, A. A. Malik, M. A. Mansournia, S. Martini, S. Z. Masoumi, P. Mathur, M. McKee, R. Mehrotra, W. Mendoza, R. G. Menezes, E. W. Mengesha, M. K. Mesregah, T. Mestrovic, J. Miao Jonasson, B. Miazgowski, T. Miazgowski, I. M. Michalek, T. R. Miller, H. Mirzaei, H. R. Mirzaei, S. Misra, P. Mithra, M. Moghadaszadeh, K. A. Mohammad, Y. Mohammad, M. Mohammadi, S. M. Mohammadi, A. Mohammadian-Hafshejani, S. Mohammed, N. Moka, A. H. Mokdad, M. Molokhia, L. Monasta, M. A. Moni, M. A. Moosavi, Y. Moradi, P. Moraga, J. Morgado-da-Costa, S. D. Morrison, A. Mosapour, S. Mubarik, L. Mwanri, A. J. Nagarajan, S. P. Nagaraju, C. Nagata, M. D. Naimzada, V. Nangia, A. A. Naqvi, S. Narasimha Swamy, R. Ndejjo, S. O. Nduaguba, I. Negoi, S. M. Negru, S. Neupane Kandel, C. T. Nguyen, H. L. T. Nguyen, R. K. Niazi, C. A. Nnaji, N. M. Noor, V. Nunez-Samudio, C. I. Nzoputam, B. Oancea, C. Ochir, O. O. Odukoya, F. A. Ogbo, A. T. Olagunju, B. O. Olakunde, E. Omar, A. Omar Bali, A. E. E. Omonisi, S. Ong, O. E. Onwujekwe, H. Orru, D. V. Ortega-Altamirano, N. Otstavnov, S. S. Otstavnov, M. O. Owolabi, A. M. P, J. R. Padubidri, K. Pakshir, A. Pana, D. Panagiotakos, S. Panda-Jonas, S. Pardhan, E. C. Park, E. K. Park, F. Pashazadeh Kan, H. K. Patel, J. R. Patel, S. Pati, S. M. Pattanshetty, U. Paudel, D. M. Pereira, R. B. Pereira, A. Perianayagam, J. D. Pillay, S. Pirouzpanah, F. Pishgar, I. Podder, M. J. Postma, H. Pourjafar, A. Prashant, L. Preotescu, M. Rabiee, N. Rabiee, A. Radfar, R. A. Radhakrishnan, V. Radhakrishnan, A. Rafiee, F. Rahim, S. Rahimzadeh, M. Rahman, M. A. Rahman, A. M. Rahmani, N. Rajai, A. Rajesh, I. Rakovac, P. Ram, K. Ramezanzadeh, K. Ranabhat, P. Ranasinghe, C. R. Rao, S. J. Rao, R. Rawassizadeh, M. S. Razeghinia, A. M. N. Renzaho, N. Rezaei, N. Rezaei, A. Rezapour, T. J. Roberts, J. A. B. Rodriguez, P. Rohloff, M. Romoli, L. Ronfani, G. Roshandel, G. M. Rwegerera, M. S, S. Sabour, B. Saddik, U. Saeed, A. Sahebkar, H. Sahoo, S. Salehi, M. R. Salem, H. Salimzadeh, M. Samaei, A. M. Samy, J. Sanabria, S. Sankararaman, M. M. Santric-Milicevic, Y. Sardiwalla, A. Sarveazad, B. Sathian, M. Sawhney, M. Saylan, I. J. C. Schneider, M. Sekerija, A. Seylani, O. Shafaat, Z. Shaghaghi, M. A. Shaikh, E. Shamsoddin, M. Shannawaz, R. Sharma, A. Sheikh, S. Sheikhbahaei, A. Shetty, J. K. Shetty, P. H. Shetty, K. Shibuya, R. Shirkoohi, K. M. Shivakumar, V. Shivarov, S. Siabani, S. K. Siddappa Malleshappa, D. A. S. Silva, J. A. Singh, Y. Sintayehu, V. Y. Skryabin, A. A. Skryabina, M. J. Soeberg, A. Sofi-Mahmudi, H. Sotoudeh, P. Steiropoulos, K. Straif, R. Subedi, M. B. Sufiyan, I. Sultan, S. Sultana, D. Sur, V. Szerencses, M. Szocska, R. Tabares-Seisdedos, T. Tabuchi, H. Tadbiri, A. Taherkhani, K. Takahashi, I. M. Talaat, K. K. Tan, V. Y. Tat, B. A. A. Tedla, Y. G. Tefera, A. Tehrani-Banihashemi, M. H. Temsah, F. H. Tesfay, G. A. Tessema, R. Thapar, A. Thavamani, V. Thoguluva Chandrasekar, N. Thomas, H. R. Tohidinik, M. Touvier, M. R. Tovani-Palone, E. Traini, B. X. Tran, K. B. Tran, M. T. N. Tran, J. P. Tripathy, B. S. Tusa, I. Ullah, S. Ullah, K. K. Umapathi, B. Unnikrishnan, E. Upadhyay, M. Vacante, M. Vaezi, S. Valadan Tahbaz, D. Z. Velazquez, M. Veroux, F. S. Violante, V. Vlassov, B. Vo, V. Volovici, G. T. Vu, Y. Waheed, R. G. Wamai, P. Ward, Y. F. Wen, R. Westerman, A. S. Winkler, L. Yadav, S. H. Yahyazadeh Jabbari, L. Yang, S. Yaya, T. S. Y. Yazie, Y. Yeshaw, N. Yonemoto, M. Z. Younis, Z. Yousefi, C. Yu, D. Yuce, I. Yunusa, V. Zadnik, F. Zare, M. S. Zastrozhin, A. Zastrozhina, J. Zhang, C. Zhong, L. Zhou, C. Zhu, A. Ziapour, I. R. Zimmermann, C. Fitzmaurice, C. J. L. Murray, and L. M. Force. 2022. "Cancer Incidence, Mortality, Years of Life Lost, Years Lived With Disability, and Disability-Adjusted Life Years for 29 Cancer Groups From 2010 to 2019: A Systematic Analysis for the Global Burden of Disease Study 2019." JAMA Oncol 8 (3): 420-444. https://doi.org/10.1001/jamaoncol.2021.6987. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/34967848.
Han, Y., D. Wang, L. Peng, T. Huang, X. He, J. Wang, and C. Ou. 2022. "Single-cell sequencing: a promising approach for uncovering the mechanisms of tumor metastasis." J Hematol Oncol 15 (1): 59. https://doi.org/10.1186/s13045-022-01280-w. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/35549970.
Janesick, Amanda, Robert Shelansky, Andrew D. Gottscho, Florian Wagner, Morgane Rouault, Ghezal Beliakoff, Michelli Faria de Oliveira, Andrew Kohlway, Jawad Abousoud, Carolyn A. Morrison, Tingsheng Yu Drennon, Seayar H. Mohabbat, Stephen R. Williams, and Sarah E.B. Taylor. 2022. "High resolution mapping of the breast cancer tumor microenvironment using integrated single cell, spatial and in situ analysis of FFPE tissue." bioRxiv: 2022.10.06.510405. https://doi.org/10.1101/2022.10.06.510405. https://www.biorxiv.org/content/biorxiv/early/2022/11/03/2022.10.06.510405.full.pdf.
Jia, Q., H. Chu, Z. Jin, H. Long, and B. Zhu. 2022. "High-throughput single-cell sequencing in cancer research." Signal Transduct Target Ther 7 (1): 145. https://doi.org/10.1038/s41392-022-00990-4. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/35504878.
Jovic, D., X. Liang, H. Zeng, L. Lin, F. Xu, and Y. Luo. 2022. "Single-cell RNA sequencing technologies and applications: A brief overview." Clin Transl Med 12 (3): e694. https://doi.org/10.1002/ctm2.694. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/35352511.
Liu, Z., H. Li, Q. Dang, S. Weng, M. Duo, J. Lv, and X. Han. 2022. "Integrative insights and clinical applications of single-cell sequencing in cancer immunotherapy." Cell Mol Life Sci 79 (11): 577. https://doi.org/10.1007/s00018-022-04608-4. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/36316529.
Luecken, M. D., and F. J. Theis. 2019. "Current best practices in single-cell RNA-seq analysis: a tutorial." Mol Syst Biol 15 (6): e8746. https://doi.org/10.15252/msb.20188746. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/31217225.
Ma, L., M. O. Hernandez, Y. Zhao, M. Mehta, B. Tran, M. Kelly, Z. Rae, J. M. Hernandez, J. L. Davis, S. P. Martin, D. E. Kleiner, S. M. Hewitt, K. Ylaya, B. J. Wood, T. F. Greten, and X. W. Wang. 2019. "Tumor Cell Biodiversity Drives Microenvironmental Reprogramming in Liver Cancer." Cancer Cell 36 (4): 418-430 e6. https://doi.org/10.1016/j.ccell.2019.08.007. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/31588021.
MacParland, S. A., J. C. Liu, X. Z. Ma, B. T. Innes, A. M. Bartczak, B. K. Gage, J. Manuel, N. Khuu, J. Echeverri, I. Linares, R. Gupta, M. L. Cheng, L. Y. Liu, D. Camat, S. W. Chung, R. K. Seliga, Z. Shao, E. Lee, S. Ogawa, M. Ogawa, M. D. Wilson, J. E. Fish, M. Selzner, A. Ghanekar, D. Grant, P. Greig, G. Sapisochin, N. Selzner, N. Winegarden, O. Adeyi, G. Keller, G. D. Bader, and I. D. McGilvray. 2018. "Single cell RNA sequencing of human liver reveals distinct intrahepatic macrophage populations." Nat Commun 9 (1): 4383. https://doi.org/10.1038/s41467-018-06318-7. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/30348985.
Perdyan, A., U. Lawrynowicz, M. Horbacz, B. Kaminska, and J. Mieczkowski. 2022. "Integration of single-cell RNA sequencing and spatial transcriptomics to reveal the glioblastoma heterogeneity." F1000Res 11: 1180. https://doi.org/10.12688/f1000research.126243.1. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/36875988.
Regan, C., and J. Preall. 2022. "Practical Considerations for Single-Cell Genomics." Curr Protoc 2 (8): e498. https://doi.org/10.1002/cpz1.498. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/35926125.
Sun, G., Z. Li, D. Rong, H. Zhang, X. Shi, W. Yang, W. Zheng, G. Sun, F. Wu, H. Cao, W. Tang, and Y. Sun. 2021. "Single-cell RNA sequencing in cancer: Applications, advances, and emerging challenges." Mol Ther Oncolytics 21: 183-206. https://doi.org/10.1016/j.omto.2021.04.001. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/34027052.
Suva, M. L., and I. Tirosh. 2019. "Single-Cell RNA Sequencing in Cancer: Lessons Learned and Emerging Challenges." Mol Cell 75 (1): 7-12. https://doi.org/10.1016/j.molcel.2019.05.003. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/31299208.
Zhang, M., H. Yang, L. Wan, Z. Wang, H. Wang, C. Ge, Y. Liu, Y. Hao, D. Zhang, G. Shi, Y. Gong, Y. Ni, C. Wang, Y. Zhang, J. Xi, S. Wang, L. Shi, L. Zhang, W. Yue, X. Pei, B. Liu, and X. Yan. 2020. "Single-cell transcriptomic architecture and intercellular crosstalk of human intrahepatic cholangiocarcinoma." J Hepatol 73 (5): 1118-1130. https://doi.org/10.1016/j.jhep.2020.05.039. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/32505533.
Refbacks
- There are currently no refbacks.
Informatics Studies: ISSN: 2583-8994 (Online), 2320-530X (Print)